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R语言在生信分析论文中的应用与代码技巧

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简介：
本课程聚焦于利用R语言进行生物信息学数据分析及论文写作，涵盖数据处理、统计分析、可视化展示等关键技能，并分享实用编程技巧。 TCGA GEO数据处理包括基因注释、差异分析以及GO、KEGG和GSEA富集分析。此外还包括肿瘤突变负荷与免疫浸润的评估，LASSO回归、随机森林及SVM-RFE等机器学习方法的应用，COX回归用于生存预测模型构建，WGCNA网络进行相关性分析，并采用共识聚类以发现样本亚群特征。同时也会探索药物敏感性的关系以及干性和免疫浸润指数的影响，最终建立预后模型。这些工作均涉及R语言编程实现相应代码。

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  • R语言在生信分析论文中的应用与代码技巧
    优质
    本课程聚焦于利用R语言进行生物信息学数据分析及论文写作，涵盖数据处理、统计分析、可视化展示等关键技能，并分享实用编程技巧。 TCGA GEO数据处理包括基因注释、差异分析以及GO、KEGG和GSEA富集分析。此外还包括肿瘤突变负荷与免疫浸润的评估，LASSO回归、随机森林及SVM-RFE等机器学习方法的应用，COX回归用于生存预测模型构建，WGCNA网络进行相关性分析，并采用共识聚类以发现样本亚群特征。同时也会探索药物敏感性的关系以及干性和免疫浸润指数的影响，最终建立预后模型。这些工作均涉及R语言编程实现相应代码。
     
  • R语言在医学统计分析中的应用
    优质
    本课程介绍如何利用R语言进行医学数据的统计分析，涵盖从基础的数据处理到高级的模型构建与结果解读。 相较于 R 在其他行业的广泛应用，在医学领域其应用相对较少。目前，SPSS 和 SAS 是该领域的主流工具。本书旨在介绍 R 语言在医学研究中的具体应用，并使用 markdown 的衍生版本 R Markdown（Rmd）V2 进行编写工作，在 TeXLive 环境下通过 xelatex 编译完成。书中所有涉及的 R 代码均基于 knitr 包来运行和生成，且已在 R 3.2 版本中进行了严格的测试验证。操作系统环境为 Linux Mint 17.2。
     
  • R语言及Bioconductor在生物信息学中的应用_
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    本课程介绍R语言及其在生物信息学分析中的强大工具包Bioconductor的基础知识和高级功能，帮助学生掌握数据处理、统计分析与可视化技能。 这本书详细介绍了R与Bioconductor在生物信息学中的应用。不仅深入讲解了相关生物信息学内容，还涵盖了算法流程及程序编程等方面的知识。
     
  • R语言在代谢组学数据中的应用分析.zip
    优质
    本资料深入探讨了R语言在代谢组学数据分析中的应用，涵盖数据预处理、特征选择及模式识别等环节，旨在帮助研究者高效解析复杂代谢物信息。 R语言代谢组学数据分析教程供学习参考。
     
  • R语言及BIOCONDUCTOR在生物信息学中的应用.rar
    优质
    本资源介绍了R语言及其专为生物信息学设计的Bioconductor库的应用。通过实例演示如何使用这些工具进行基因表达分析、数据可视化和统计推断，助力科研人员高效开展生物学研究。 《R语言与BIOCONDUCTOR生物信息学应用》书籍影印版，PDF。
     
  • 时间序列分析在R语言中的应用.pdf
    优质
    本PDF深入浅出地介绍了如何使用R语言进行时间序列分析，涵盖数据处理、模型构建与预测等核心内容，适合数据分析及统计学爱好者学习参考。 学习R语言的时间序列分析教程，包括理论知识和代码实践。
     
  • R语言_时间序列分析在消费者信心指数中的应用代码.Rmd
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    本R Markdown文档展示了如何利用R语言进行时间序列分析，特别针对消费者信心指数的数据集，提供详细的代码和解释。通过该文件的学习者可以掌握数据预处理、模型构建及预测等技能。 利用ARIMA模型、Holt-Winters指数平滑法以及条件异方差模型对消费者信心指数的时间序列进行分析与预测，并针对三种消费者景气指数（包括信心指数、预期指数及满意指数）开展协整检验，这是课程期末大作业报告的一部分。代码使用R语言编写，数据来源于中经网统计数据库。本段文字仅供参考，欢迎提出修改意见和建议。
     
  • R语言在大数据分析中的统计方法与应用
    优质
    本书专注于讲解如何利用R语言进行复杂的大数据分析，涵盖多种统计方法及其实际应用场景，帮助读者掌握数据科学的核心技能。 R语言在大数据分析中的统计方法及应用是数据分析领域的重要内容。相关的精品资料可以帮助学习者深入理解和掌握这些技术。
     
  • R语言生物信息学分析
    优质
    《R语言生物信息学分析》是一本介绍如何利用R编程语言进行生物学数据处理与统计分析的专业书籍，涵盖基因表达、序列比对等主题。 在R语言的生物信息分析中，可以使用vegan包进行Anosim分析。
     
  • R语言在环境与生态统计中的应用.pdf
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    本PDF深入探讨了R语言在环境科学及生态学数据分析中的应用，涵盖数据处理、模型构建与可视化技术，为科研人员提供实用工具和方法。 生态类书籍供学习参考。