
MS Forcite交互能量脚本 InteractionEnergy.pl,备受青睐的分子动力学下载佳作(1万次下载)!
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简介:
InteractionEnergy.pl是一款广受好评的MS Forcite工具,用于计算分子间的交互能量。凭借其精确性和高效性,该脚本已成为分子动力学研究者的必备资源,累计下载量突破1万次。
计算相互作用能(也称为结合能)的公式为:
E(interaction)=E(layer1+2) - E(layer1) - E(layer2)
在研究不同片段间的相互作用,如无机表面与溶液、无机表面与聚合物或两个聚合物之间的关系时,需要运行分子动力学模拟,并对每一帧中的两层结构分别进行能量计算。当轨迹包含数万帧数据时,手动处理可能耗时一年之久;然而使用脚本则可在不到一分钟内完成。
这是MS官方相互作用能脚本的第4次改进版本(首次发布于2009年),专为Forcite、Gulp和Mesocite模块设计。该脚本由BIOVIA公司的Stephen Todd开发,他还有一款针对DMol3设计的类似功能脚本,在后续的文章中会进行介绍。
完整的脚本代码已展示在本段落下方,请通过后台留言“脚本”获取(包含32个相关脚本)。
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