
ART-DeCo:利用多态性等位基因比率进行污染预测-开源
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简介:
ART-DeCo是一款用于通过分析多态性等位基因比率来预测DNA污染程度的开源工具,适用于遗传学和法医学研究。
ART-DeCo 是一种用于在 NGS 基因组分析中检测污染的工具。它利用目标区域内的单核苷酸多态性(SNP)的等位基因比率(AR),当样本受到具有不同基因型的 DNA 污染时,会观察到意外的 AR 变化。ART-DeCo 通过筛选测试来识别污染物,并进一步鉴定和量化这些污染。该工具适用于从基因组到全基因组分析的各种 NGS 工作流程。任何多态性都有助于检测过程,尤其需要考虑连锁不平衡中的稀有 SNP 和 SNP 来合并预计的污染情况。
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