LAMMPS安装与运行指南（自制版 2020）

简介：
本指南详细介绍了如何在不同操作系统下安装和配置LAMMPS软件，并提供了运行示例模拟的基本步骤及常见问题解决方案。适合初学者快速上手使用。 ### LAMMPS安装运行手册详细知识点 #### 一、LAMMPS概述 LAMMPS是一款分子动力学模拟软件，在软材料和固体物理系统的仿真中得到广泛应用。其主要优势在于兼容大多数势能模型，并且因为高效的编程与计算能力，适用于高要求的科研项目。此外，它支持单核串行计算及多核并行计算等多种模式。 #### 二、LAMMPS安装 ##### 1. 单核串行安装 - 访问官网下载适合Windows系统的预编译二进制执行文件。 - 下载页面选择最新稳定版本进行下载。 - 安装适用于单核的64位版，适用于大多数笔记本电脑和台式机环境。 - 双击安装程序开始安装。完成后不会生成桌面快捷方式。 ##### 2. 多核并行安装 - 对于多核计算需求，选择LAMMPS的MPICH版本进行下载与安装（适合服务器）。 - 安装完毕后，在Example文件夹中通过示例了解如何运行程序。 - 在此之前需先完成MPICH2环境配置。使用管理员权限将该软件正确安装至系统。 #### 三、LAMMPS运行 ##### 1. 单核串行运行 - 创建一个名为lammps的文件夹，并在此放置lmp_serial.exe和输入脚本。 - 使用命令提示符进入此目录，执行`lmp_serial < in.crack`来启动模拟过程。 - 模拟完成后将生成日志文件log.lammps及输出结果dump.colloid。可利用OVITO软件进行可视化分析。 ##### 2. 多核并行运算 - 把MPICH的mpiexec和smpd程序复制到运行目录中，同时放置输入脚本。 - 使用管理员权限打开命令提示符，并通过`mpiexec -n lmp_mpi`启动模拟计算任务。 #### 四、安装运行注意事项 - 安装过程中需确保具有足够的权限（如以管理员身份操作）特别是对于并行环境的MPICH2软件。 - 在设置系统路径时，需要将LAMMPS和MPICH的二进制文件夹添加到环境变量中。 - 文件存放位置及命令提示符中的输入命令应当准确无误地进行调整。 - 运行结束后产生的结果文件需正确解读，并通过专用工具（如OVITO）辅助分析。 以上内容详细介绍了LAMMPS软件安装与运行步骤，包括不同计算模式下的具体操作方法和注意事项。这将帮助用户顺利开展分子动力学模拟研究工作。