
解决使用pip或conda安装mdtraj失败的问题方法
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简介:
简介:本文提供了针对使用pip或conda安装mdtraj过程中遇到问题的解决方案,帮助用户顺利完成科学计算库的安装。
MDTraj 是一个用于分子动力学模拟的 Python 库,相比 MDAnalysis 来说更易于操作且更加符合 Python 的编程风格。它可以实现不同模拟软件之间的轨迹转换、常规计算及分析等功能。简单来说,它可用于对轨迹进行分析,并通过计算 RMSD 和 RMSF 值来判断轨迹的变化情况等。
在 MDTraj 1.9.3 版本中新增了计算 RMSF 的功能,因此需要此功能的用户最好安装该版本。
为了使用 MDTraj,首先需要安装 numpy 和 cython 等环境依赖项,并确保这些库是最新版本。因为旧版本可能缺少某些必要的依赖项。
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