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FewShot_GAN-Unet3D的TensorFlow实现:基于生成对抗网络的少量样本3D多模态医学图像分割

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简介:
本项目为FewShot_GAN-Unet3D的TensorFlow版本,旨在通过生成对抗网络技术解决少量样本条件下3D多模态医学图像的高效准确分割问题。 使用生成式对抗学习的3D医学图像分割方法在此存储库中有详细的实现:该代码同时在tensorflow和pytorch环境中可用。要运行该项目,请参考各个自述文件中的指导信息。 我们选择了特定的数据集来验证所提出的方法的有效性,它包含10个标记训练对象和13个未标记测试对象的3D多模式脑MRI数据。这10个标记的训练图像被进一步分为两组模型的训练、验证和测试用图(例如,2, 1 和7)。剩余的13个未标记测试图像仅用于基于GAN模型的训练。 该数据集还包含三种成像模式:T1加权、T1加权反转恢复及FLAIR。这些原始数据被用来评估我们提出的模型在不同情况下的鲁棒性表现。

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  • FewShot_GAN-Unet3DTensorFlow3D
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    本项目为FewShot_GAN-Unet3D的TensorFlow版本,旨在通过生成对抗网络技术解决少量样本条件下3D多模态医学图像的高效准确分割问题。 使用生成式对抗学习的3D医学图像分割方法在此存储库中有详细的实现:该代码同时在tensorflow和pytorch环境中可用。要运行该项目,请参考各个自述文件中的指导信息。 我们选择了特定的数据集来验证所提出的方法的有效性,它包含10个标记训练对象和13个未标记测试对象的3D多模式脑MRI数据。这10个标记的训练图像被进一步分为两组模型的训练、验证和测试用图(例如,2, 1 和7)。剩余的13个未标记测试图像仅用于基于GAN模型的训练。 该数据集还包含三种成像模式:T1加权、T1加权反转恢复及FLAIR。这些原始数据被用来评估我们提出的模型在不同情况下的鲁棒性表现。
  • TF-3DGAN: TensorFlow3D.zip
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    本资料提供了一个基于TensorFlow框架的源代码库,用于实现和实验3D生成对抗网络(3DGAN),致力于促进3D模型的合成与创新研究。 TF-3DGAN 是一个基于生成对抗性网络的 Tensorflow 实现,用于学习对象形状的概率潜在空间。该项目提供了一个带有交互式卷图的博客文章来详细介绍其工作原理和技术细节。需要使用 TensorFlow 进行运行。
  • 融合
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    本研究提出了一种创新的方法,利用生成对抗网络(GAN)技术实现多模态医学影像的有效融合。该方法旨在提高影像质量及信息丰富度,以支持更精准的医疗诊断和治疗决策。 针对多模态图像融合过程中遇到的多尺度几何工具应用及融合规则设计难题,本段落提出了一种基于生成对抗网络(GANs)的创新性图像融合方法,能够实现多模态图像端到端的自适应融合。该方法将多种源图像同时输入至基于残差结构的卷积神经网络作为生成器,通过深度学习技术自动合成高质量的融合图像;随后,生成的融合图与标准标签图分别送入判别网络进行特征提取和分类识别,并以此反馈优化生成器性能,在不断迭代中达到两者的动态平衡。实验结果显示,相较于现有的代表性方法而言,本研究提出的方案能够产生更加清晰、无伪影且视觉效果更佳的图像融合结果。
  • 压缩:极端压缩TensorFlow
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    本项目采用生成对抗网络与极端学习机结合的方法,在TensorFlow平台上实现了高效的图像压缩技术,旨在减少存储需求同时保持图像质量。 生成压缩使用TensorFlow实现的生成对抗网络来学习图像压缩的方法由Agustsson等人提出,并对其方法进行了详细描述。 用法: 1. 克隆代码库: ``` $ git clone https://github.com/Justin-Tan/generative-compression.git $ cd generative-compression ``` 2. 训练模型时,查看命令行参数以了解如何使用`train.py`脚本。可以通过以下方式获取帮助信息: ``` $ python3 train.py -h ``` 3. 运行训练代码: ``` $ python3 train.py -opt momen ```
  • 修复
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    本研究提出了一种利用生成对抗网络(GAN)进行图像修复的方法,通过学习受损区域与完整图像间的映射关系,实现高精度的像素恢复和纹理合成。 一种基于GAN(生成对抗网络)的图像修复算法,利用CELEBA数据集进行训练。该算法通过随机掩膜对图片造成损坏以测试其修复能力。
  • TensorFlow深度卷积代码
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    本项目基于TensorFlow框架,实现了深度卷积生成对抗网络(DCGAN)的代码。通过该网络可以生成高质量的图像数据,为机器学习研究提供有力支持。 TensorFlow实现的深度卷积生成对抗网络(DCGAN),这是一种稳定生成对抗网络的方法。
  • Densenet_FCN: TensorFlow密集与FCN结合方法
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    简介:本文提出了一种基于TensorFlow框架的创新医学图像分割技术——Densenet_FCN,该技术将密集网络和全卷积网络相结合,有效提升分割精度与效率。 Densenet_FCN 使用FCN的密集网的张量流实现以进行肝脏分割。逐步配置模型的所有基本设置和训练过程均在config.py中列出,并由EasyDict管理。我们将配置参数定义为__C,该参数在config.py文件中定义。 所有配置都可能会在一个额外的文件./config/dice_skipv2.yml中被重置,它将覆盖config.py中的原有配置。我们建议您为自己的配置编写一个新的.yml文件,而不是修改config.py本身。 1. 准备数据集 数据集根目录设置为__C.DATA.ROOT_DIR 。您可以根据使用的操作系统(Windows或Linux)指定路径,代码会自动识别该路径。然后,分别通过__C.DATA.TRAINSET 、 __C.DATA.TESTSET和__C.DATA.VALSET 设置训练集、测试集及验证集的数据目录。 下面是一个示例的目录结构: - liver:保存所有2D肝脏切片。 - mask:包含对应的掩码图像。
  • V-GAN-tensorflow在眼底镜中进行视膜血管方法
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    V-GAN-tensorflow 是一种创新方法,利用生成对抗网络(GAN)和TensorFlow框架,在眼底镜图像中高效准确地实现视网膜血管自动分割。该技术为眼科疾病的早期诊断提供了强大工具。 Tensorflow中的V-GAN实现存储库包含参考的Keras代码。 改进之处包括: 1. 数据扩充从离线过程改为在线处理,解决了内存限制问题但会减慢训练速度。 2. 引入了`train_interval FLAGS`以控制生成器和鉴别器之间的训练迭代。对于普通GAN,`train_interval`为1。 3. 根据验证数据的AUC_PR和AUC_ROC之和来保存最佳模型。 4. 添加采样功能以便在训练过程中检查生成的结果,并了解其变化情况。 5. 在张量板上绘制测量结果以进行可视化。 代码编写更加结构化。所使用的包依赖包括: - Tensorflow 1.6.0 - Python 3.5.3 - Numpy 1.14.2 - Matplotlib 2.0.2 - Pillow 5.0.0 - Scikit-image 0.13.0 - Scikit-learn 0.19.0 - SciPy
  • 糊技术:DeblurGAN
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    简介:DeblurGAN是一种创新的图像处理方法,利用生成对抗网络(GAN)来实现高效的图像去模糊处理。通过优化卷积神经网络参数,该模型能够生成清晰度高、细节丰富的图片,极大提升视觉体验和图像分析质量。 DeblurGAN是一个使用条件对抗网络进行盲运动去模糊的Pytorch实现。该网络接收模糊图像作为输入,并生成相应的清晰估计结果。 我们采用的是带基于VGG-19激活函数的渐变惩罚和感知损失的条件性Wasserstein GAN模型,这种架构在其他图像到图像转换问题(如超分辨率、着色、修复及除雾等)上也表现出良好性能。 运行DeblurGAN需要满足以下先决条件:NVIDIA GPU + CUDA CuDNN (CPU版本未经测试)。此外,请确保安装了Torch并下载了权重文件。在进行推断时,只需保留生成器的权重即可。