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CellPose:一款通用的细胞分割算法

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简介:
CellPose是一款先进的开源软件工具,用于自动执行图像中的细胞分割任务。它能够处理多种类型的细胞和组织样本,为生物医学研究提供高效准确的数据分析解决方案。 细胞姿态是一种用于细胞及细胞核分割的通用算法,由Carsen Stringer 和 Marius Pachitariu编写。如需了解Cellpose,请查阅相关文档或观看演讲视频。如果您需要支持,请通过适当渠道提出问题。 更新 v0.6(2020年12月):Pytorch现在成为cellpose默认的深度神经网络软件,但仍然会继续支持Mxnet。若要安装mxnet (CPU),请运行pip install mxnet-mkl 。在笔记本中使用mxnet时,请在创建模型时声明 torch=False ,例如 model = models.Cellpose(torch=False) 。如果要在命令行上使用 mxnet,则需添加标志--mxnet,如 python -m 指令。

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客服
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  • CellPose
    优质
    CellPose是一款先进的开源软件工具,用于自动执行图像中的细胞分割任务。它能够处理多种类型的细胞和组织样本,为生物医学研究提供高效准确的数据分析解决方案。 细胞姿态是一种用于细胞及细胞核分割的通用算法,由Carsen Stringer 和 Marius Pachitariu编写。如需了解Cellpose,请查阅相关文档或观看演讲视频。如果您需要支持,请通过适当渠道提出问题。 更新 v0.6(2020年12月):Pytorch现在成为cellpose默认的深度神经网络软件,但仍然会继续支持Mxnet。若要安装mxnet (CPU),请运行pip install mxnet-mkl 。在笔记本中使用mxnet时,请在创建模型时声明 torch=False ,例如 model = models.Cellpose(torch=False) 。如果要在命令行上使用 mxnet,则需添加标志--mxnet,如 python -m 指令。
  • MATLAB计数_Bb.zip_水岭_水岭
    优质
    本资源包提供了一种基于MATLAB的细胞图像处理技术,采用分水岭算法进行细胞自动识别与精确计数。通过先进的图像分割方法,有效提高细胞分析效率和准确性,适用于生物医学研究领域。 采用中值滤波和分水岭法去除小面积区域来实现紫色细胞的计数。
  • 】基于水岭与计数MATLAB源码(含GUI).zip
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    本资源提供了一套利用分水岭算法实现细胞图像自动分割和计数的MATLAB代码,附带图形用户界面(GUI),便于操作和分析。适合生物医学工程研究者使用。 【细胞分割】基分水岭算法实现细胞分割计数matlab源码含 GUI.zip
  • 】基于水岭与计数MATLAB源码(含GUI).md
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    这段文档提供了一个使用MATLAB编写的基于分水岭算法进行细胞图像分割和计数的完整解决方案,包含用户图形界面(GUI),便于科研人员及学生在生物医学图像处理中应用。 【细胞分割】基分水岭算法实现细胞分割计数matlab源码含 GUI.md 该文档介绍了使用基于分水岭算法的MATLAB代码进行细胞图像的自动分割与计数的方法,同时包含了一个图形用户界面(GUI)以便于操作和展示结果。
  • 粘连
    优质
    本研究提出了一种新颖的图像处理技术,专注于改善细胞粘连区域的精确分割,以促进生物学和医学领域的深入分析。 该程序在粘连细胞的分割上表现良好,采用了极限腐蚀和分水岭方法,算法设计简洁明了,非常适合初学者学习使用。
  • 图像水岭
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    本研究提出了一种高效的细胞图像分水岭分割算法,通过改进传统分水岭方法过度分割的问题,有效提升了细胞边界的识别精度和速度。 本程序是基于MATLAB开发的分水岭细胞图像分割算法,采用创新的分水岭分割方法,能够实现更明显的分割效果。
  • 粘连牙桥.rar
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    本研究探讨了一种创新的“牙桥法”技术在粘连细胞图像中的应用,旨在有效实现细胞分割。该方法通过模拟牙齿桥梁结构,精确分离紧密连接或重叠的细胞,提高了生物医学图像分析的准确性和效率。 利用腐蚀、膨胀或运算等方法可以优化分水岭分割图像,从而在粘连细胞的分割计数上取得较好的效果。
  • 【红计数】利形态学进行Matlab代码(附GUI).zip
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    本资源提供了一套基于形态学方法实现红细胞自动识别与计数的MATLAB程序及图形用户界面,适用于生物医学图像处理研究和教学。 【细胞分割】基于形态学算法实现红细胞计数的MATLAB源码包含GUI功能的压缩文件。
  • 】利中值滤波与水岭进行计数MATLAB代码.zip
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    本资源提供了一套基于MATLAB实现的细胞图像处理方案,通过应用中值滤波和分水岭变换技术来精确地识别并统计细胞数量。该工具包适用于生物医学研究领域内的细胞分析工作,能够有效提升细胞计数与分割的准确性和效率。 【细胞分割】基于中值滤波+分水岭法实现细胞计数的MATLAB源码ZIP文件。
  • 和计数
    优质
    细胞的分割和计数主要介绍在生物医学领域中用于分析显微图像的技术与方法,包括自动化的细胞识别、跟踪及量化过程,助力科研人员高效处理大规模数据。 使用MATLAB进行细胞分割与计数可以采用大津阈值法。这种方法能够有效地将细胞从背景中分离出来,并对图像中的细胞进行准确的计数。在实现过程中,首先需要预处理原始图像以增强对比度并减少噪声的影响;然后应用大津阈值算法确定最佳二值化阈值;最后通过形态学操作和连通域分析来识别和标记每个独立的细胞单元,从而完成对细胞数量的统计工作。