
CellPose:一款通用的细胞分割算法
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简介:
CellPose是一款先进的开源软件工具,用于自动执行图像中的细胞分割任务。它能够处理多种类型的细胞和组织样本,为生物医学研究提供高效准确的数据分析解决方案。
细胞姿态是一种用于细胞及细胞核分割的通用算法,由Carsen Stringer 和 Marius Pachitariu编写。如需了解Cellpose,请查阅相关文档或观看演讲视频。如果您需要支持,请通过适当渠道提出问题。
更新 v0.6(2020年12月):Pytorch现在成为cellpose默认的深度神经网络软件,但仍然会继续支持Mxnet。若要安装mxnet (CPU),请运行pip install mxnet-mkl 。在笔记本中使用mxnet时,请在创建模型时声明 torch=False ,例如 model = models.Cellpose(torch=False) 。如果要在命令行上使用 mxnet,则需添加标志--mxnet,如 python -m 指令。
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