
Matlab图像阈值分割代码 - 自动树结构提取:二维图像的自动提取树状结构。
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简介:
该软件包旨在为二维图像的树结构提取提供一种高效的解决方案。它能够自动地识别并输出与每个细胞相关的神经突痕迹。为了便于理解和应用,详细信息已包含在论文中,具体内容请参考... 此外,关于包内文件的列表及其相关说明,可查阅 `contents.m` 文件。使用该程序的主要输入包括分段的soma掩码以及分段的二进制图像。主文件夹中包含了用于测试的样例数据,例如 `inputSeg.mat`(分段图像),`inputSoma.mat`(分段soma掩码)。其他相关数据则位于子文件夹“数据集”中,每个数据都对应一个 `.tif` 原始堆栈的最大强度投影文件、一个名为 `inputSeg_..` 的 Matlab 分割图像文件以及一个名为 `inputSoma_..` 的 Matlab 分割soma图像文件。在soma分割过程中,依赖于当前使用的代码。关键参数设置位于 `runCenterLineParallel.m` 文件中进行种子搜索,若需调整,可以修改这些参数。另一个重要的参数是种子搜索策略。
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